MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 53188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021082	GCTC	2	8	261087	261094	0 %	25 %	25 %	50 %	482884973
5002	NC_021082	AAG	2	6	261110	261115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884973
5003	NC_021082	AAC	2	6	261167	261172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884973
5004	NC_021082	ATT	2	6	261185	261190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884973
5005	NC_021082	A	6	6	261254	261259	100 %	0 %	0 %	0 %	482884973
5006	NC_021082	TTA	2	6	261485	261490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884973
5007	NC_021082	CAA	2	6	261501	261506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884973
5008	NC_021082	CCG	2	6	261570	261575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884973
5009	NC_021082	AGA	2	6	261585	261590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884973
5010	NC_021082	ATA	2	6	261686	261691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884973
5011	NC_021082	ATA	2	6	261758	261763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884973
5012	NC_021082	AACGCA	2	12	261791	261802	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	482884973
5013	NC_021082	GTA	2	6	261932	261937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884974
5014	NC_021082	CGG	2	6	261952	261957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884974
5015	NC_021082	C	6	6	261960	261965	0 %	0 %	0 %	100 %	482884974
5016	NC_021082	TTAA	2	8	261986	261993	50 %	50 %	0 %	0 %	482884974
5017	NC_021082	GAA	2	6	262004	262009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884974
5018	NC_021082	GCT	2	6	262030	262035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884974
5019	NC_021082	GCT	2	6	262046	262051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884974
5020	NC_021082	ATCTCG	2	12	262233	262244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482884974
5021	NC_021082	CAGAGG	2	12	262270	262281	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	482884974
5022	NC_021082	CTT	2	6	262315	262320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884974
5023	NC_021082	ATC	2	6	262376	262381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884974
5024	NC_021082	AAC	2	6	262389	262394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884974
5025	NC_021082	CAA	2	6	262421	262426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884974
5026	NC_021082	AAT	2	6	262446	262451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884974
5027	NC_021082	CAA	2	6	262477	262482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884975
5028	NC_021082	TCA	2	6	262512	262517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884975
5029	NC_021082	CAA	2	6	262653	262658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884975
5030	NC_021082	CAA	2	6	262753	262758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884975
5031	NC_021082	GAG	2	6	262784	262789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482884975
5032	NC_021082	TGGCT	2	10	262958	262967	0 %	40 %	40 %	20 %	482884975
5033	NC_021082	CGA	2	6	262995	263000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884975
5034	NC_021082	TCT	2	6	263129	263134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884975
5035	NC_021082	CAA	2	6	263287	263292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884975
5036	NC_021082	CTTA	2	8	263307	263314	25 %	50 %	0 %	25 %	482884975
5037	NC_021082	CAA	2	6	263332	263337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884975
5038	NC_021082	CT	3	6	263433	263438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_021082	TATC	2	8	263512	263519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_021082	AAT	2	6	263534	263539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021082	CA	3	6	263541	263546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_021082	AAC	2	6	263566	263571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884976
5043	NC_021082	AAATG	2	10	263608	263617	60 %	20 %	20 %	0 %	482884976
5044	NC_021082	AGT	2	6	263650	263655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884976
5045	NC_021082	TGA	2	6	263719	263724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884976
5046	NC_021082	TGA	2	6	263758	263763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884976
5047	NC_021082	ATG	2	6	263765	263770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884976
5048	NC_021082	TC	3	6	263851	263856	0 %	50 %	0 %	50 %	482884977
5049	NC_021082	CAA	2	6	263868	263873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884977
5050	NC_021082	TTA	2	6	263913	263918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884977
5051	NC_021082	CAA	2	6	263929	263934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884977
5052	NC_021082	AT	3	6	263951	263956	50 %	50 %	0 %	0 %	482884977
5053	NC_021082	GTG	2	6	263959	263964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884977
5054	NC_021082	CA	4	8	263976	263983	50 %	0 %	0 %	50 %	482884977
5055	NC_021082	TAT	2	6	264000	264005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884977
5056	NC_021082	AT	3	6	264022	264027	50 %	50 %	0 %	0 %	482884977
5057	NC_021082	TTAT	2	8	264091	264098	25 %	75 %	0 %	0 %	482884978
5058	NC_021082	CAT	2	6	264193	264198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884978
5059	NC_021082	ATT	2	6	264330	264335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884978
5060	NC_021082	AC	3	6	264395	264400	50 %	0 %	0 %	50 %	482884978
5061	NC_021082	CAA	2	6	264418	264423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884978
5062	NC_021082	CAA	2	6	264436	264441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884978
5063	NC_021082	CAAA	2	8	264452	264459	75 %	0 %	0 %	25 %	482884978
5064	NC_021082	AAT	2	6	264526	264531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884978
5065	NC_021082	ATT	2	6	264628	264633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884978
5066	NC_021082	AGA	2	6	264648	264653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884978
5067	NC_021082	GAA	2	6	264811	264816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884978
5068	NC_021082	T	6	6	264925	264930	0 %	100 %	0 %	0 %	482884979
5069	NC_021082	GTA	2	6	264982	264987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884979
5070	NC_021082	TAT	2	6	265023	265028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884979
5071	NC_021082	CTG	2	6	265043	265048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884979
5072	NC_021082	CCT	2	6	265144	265149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482884979
5073	NC_021082	AAC	2	6	265208	265213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884979
5074	NC_021082	TCAA	2	8	265276	265283	50 %	25 %	0 %	25 %	482884979
5075	NC_021082	AGA	2	6	265290	265295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884979
5076	NC_021082	GTTCTT	2	12	265350	265361	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	482884979
5077	NC_021082	A	6	6	265437	265442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_021082	T	6	6	265456	265461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021082	CAA	2	6	265464	265469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_021082	ACT	2	6	265565	265570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884980
5081	NC_021082	GAT	2	6	265620	265625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884980
5082	NC_021082	TATTT	2	10	265695	265704	20 %	80 %	0 %	0 %	482884980
5083	NC_021082	T	6	6	265718	265723	0 %	100 %	0 %	0 %	482884980
5084	NC_021082	TGA	2	6	265835	265840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884980
5085	NC_021082	CAA	2	6	265851	265856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884980
5086	NC_021082	A	6	6	265863	265868	100 %	0 %	0 %	0 %	482884980
5087	NC_021082	CCA	2	6	265871	265876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884980
5088	NC_021082	ATACA	2	10	266030	266039	60 %	20 %	0 %	20 %	482884980
5089	NC_021082	GAAA	2	8	266120	266127	75 %	0 %	25 %	0 %	482884980
5090	NC_021082	ATT	2	6	266186	266191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884981
5091	NC_021082	GTGCA	2	10	266223	266232	20 %	20 %	40 %	20 %	482884981
5092	NC_021082	TGA	2	6	266275	266280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884981
5093	NC_021082	ATA	2	6	266292	266297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884981
5094	NC_021082	TGA	2	6	266440	266445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884981
5095	NC_021082	AT	3	6	266586	266591	50 %	50 %	0 %	0 %	482884982
5096	NC_021082	TTC	2	6	266632	266637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884982
5097	NC_021082	GGC	2	6	266647	266652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884982
5098	NC_021082	ATG	2	6	266747	266752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884982
5099	NC_021082	ATT	2	6	266796	266801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884982
5100	NC_021082	GAA	2	6	266842	266847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884982
5101	NC_021082	TAA	2	6	266886	266891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884982
5102	NC_021082	A	6	6	266963	266968	100 %	0 %	0 %	0 %	482884982
5103	NC_021082	A	7	7	266988	266994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021082	T	6	6	267060	267065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021082	CAA	3	9	267076	267084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_021082	A	6	6	267083	267088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021082	GGC	2	6	267106	267111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_021082	TCTT	2	8	267112	267119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5109	NC_021082	TTTTGC	2	12	267151	267162	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5110	NC_021082	TTAAA	2	10	267207	267216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021082	CGA	2	6	267220	267225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_021082	CAC	2	6	267249	267254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_021082	GTC	2	6	267324	267329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_021082	GATT	2	8	267424	267431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_021082	TCT	2	6	267432	267437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_021082	TTC	3	9	267447	267455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_021082	ACA	2	6	267540	267545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_021082	AC	3	6	267549	267554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_021082	CGT	2	6	267567	267572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_021082	CAA	2	6	267579	267584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_021082	AC	3	6	267590	267595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_021082	AGC	2	6	267744	267749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_021082	ACG	2	6	267798	267803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_021082	TGA	2	6	267878	267883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021082	CCG	2	6	267906	267911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_021082	ACC	2	6	267993	267998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_021082	TGTC	2	8	268034	268041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5128	NC_021082	GCTT	2	8	268052	268059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_021082	CTC	2	6	268112	268117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_021082	GAG	2	6	268131	268136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021082	CCA	2	6	268156	268161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5139	NC_021082	TC	3	6	268739	268744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5140	NC_021082	ACC	2	6	268769	268774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5141	NC_021082	TAA	2	6	268799	268804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_021082	TCA	2	6	268868	268873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5147	NC_021082	CTTT	2	8	269301	269308	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5157	NC_021082	CTA	2	6	270148	270153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5161	NC_021082	CTT	2	6	270339	270344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5384	NC_021082	GAA	3	9	281226	281234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884991
5385	NC_021082	GCT	2	6	281235	281240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884991
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5387	NC_021082	TAC	2	6	281286	281291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884991
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5392	NC_021082	GAC	2	6	281466	281471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884991
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5395	NC_021082	AAT	2	6	281529	281534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5396	NC_021082	GTT	2	6	281542	281547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5397	NC_021082	AAC	2	6	281580	281585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5404	NC_021082	TCG	2	6	281897	281902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884992
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5409	NC_021082	GTA	2	6	282162	282167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884992
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5413	NC_021082	CAT	2	6	282248	282253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5453	NC_021082	TCAA	2	8	284434	284441	50 %	25 %	0 %	25 %	482884994
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5456	NC_021082	ATC	2	6	284637	284642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884994
5457	NC_021082	CTG	2	6	284717	284722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884994
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5460	NC_021082	AAAT	2	8	284832	284839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5461	NC_021082	A	6	6	284855	284860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5462	NC_021082	TCAAA	2	10	284903	284912	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5463	NC_021082	AAG	2	6	284921	284926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5464	NC_021082	A	6	6	284944	284949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5465	NC_021082	TTC	2	6	284996	285001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884995
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5467	NC_021082	AG	3	6	285098	285103	50 %	0 %	50 %	0 %	482884995
5468	NC_021082	CATA	2	8	285105	285112	50 %	25 %	0 %	25 %	482884995
5469	NC_021082	A	7	7	285134	285140	100 %	0 %	0 %	0 %	482884995
5470	NC_021082	TGAT	2	8	285145	285152	25 %	50 %	25 %	0 %	482884995
5471	NC_021082	TC	3	6	285173	285178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5472	NC_021082	GTT	2	6	285201	285206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884996
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5474	NC_021082	CCA	2	6	285382	285387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884996
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5477	NC_021082	ACAGC	2	10	285435	285444	40 %	0 %	20 %	40 %	482884996
5478	NC_021082	CGC	2	6	285445	285450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884996
5479	NC_021082	TGTC	2	8	285464	285471	0 %	50 %	25 %	25 %	482884996
5480	NC_021082	CACC	2	8	285550	285557	25 %	0 %	0 %	75 %	482884996
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5486	NC_021082	AT	3	6	285920	285925	50 %	50 %	0 %	0 %	482884996
5487	NC_021082	AAT	2	6	285938	285943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5488	NC_021082	ATA	2	6	286030	286035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5489	NC_021082	CT	4	8	286051	286058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5490	NC_021082	TC	4	8	286090	286097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5491	NC_021082	GA	3	6	286108	286113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5492	NC_021082	GGC	2	6	286235	286240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884997
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5494	NC_021082	AGTG	2	8	286331	286338	25 %	25 %	50 %	0 %	482884997
5495	NC_021082	AGC	2	6	286357	286362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884997
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5497	NC_021082	CCA	2	6	286403	286408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884997
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5499	NC_021082	CAG	2	6	286475	286480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884997
5500	NC_021082	GGCAA	2	10	286515	286524	40 %	0 %	40 %	20 %	482884997

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